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東大の理科一類・二類・三類の違いを一言でいうと、「入学後に進む学部の系統」が違うということです。理一は工学・物理・数学・情報系、理二は生物・化学・農学・薬学などの生命科学系、理三は医学部医学科が主な進学先です。一方で、入試の試験問題と配点は3科類とも完全に共通で、違うのは合格最低点（ボーダー）だけ。つまり「どこが難しいか」は、データで比較できます。
この記事では、東大合格者530名の開示得点をイエナアカデミーが独自集計したデータと東京大学の公表値をもとに、3科類の違い・難易度・そして科類にかかわらず共通する合格戦略までを整理します。
理科一類・二類・三類の違い（早わかり一覧）
| 科類 | 主な進学先 | 特徴 |
|---|---|---|
| 理科一類 | 工学部・理学部（数学・物理・情報系）が中心 | 理系3科類で最も定員が多い |
| 理科二類 | 農学部・薬学部・理学部（生命科学系）が中心 | 医学部医学科への進学枠も若干名あるとされる |
| 理科三類 | 医学部医学科 | 定員は約100名とされ、日本の大学入試で最難関 |
東大は他大学と違い、入学時に学部を決めません。全員が前期課程（教養学部）で2年間学んだあと、「進学選択」で学部・学科に進みます。科類はその出発点であり、所属する科類によって各学部へ進みやすい枠の構成が異なる、という仕組みです。
したがって科類選びの本質は「入りやすさ」ではなく、2年後にどの系統へ進みたいかです。この前提を押さえたうえで、入試面の違いを見ていきます。
入試の仕組み：試験問題・配点は3科類とも共通
東大理系の入試は、科類による問題の違いが一切ありません。
- 合否判定：共通テスト110点換算＋二次試験440点＝総合550点満点（共通テストは素点1000点満点×110/1000で圧縮。2024年度は900点満点からの換算）
- 二次試験の配点：英語120・数学120・国語80・理科2科目120（計440点）
- 第一段階選抜（足切り）：共通テストの得点のみで実施。倍率は科類ごとに予告され、近年は概ね2.5〜3.5倍程度。実施されない科類・年度もあります
- 理科三類のみ、学力試験に加えて面接が実施されます
同じ問題を解いて、同じ配点で採点される。3科類の「難易度の違い」とは、純粋に合格最低点の違いです。過去問も勉強法も参考書も、理一・理二・理三で分ける必要はありません。
どっちが難しい？ 合格最低点と合格者平均で比較
東京大学公表の合格最低点（総合550点満点）を3年分並べます。
| 科類 | 2024年度 | 2025年度 | 2026年度 |
|---|---|---|---|
| 理科一類 | 326.24 | 321.00 | 303.39 |
| 理科二類 | 314.14 | 313.15 | 305.00 |
| 理科三類 | 380.48 | 368.67 | 346.09 |
ここから読み取れるポイントは3つです。
理三は「別格」
理三の合格最低点は、理一・理二より毎年40点以上高い水準です。2026年度の合格者平均（当社集計）でも、理一333.3・理二328.6に対し理三は386.7。約100名の定員に全国の最上位層が集中する、独立した最難関と考えるべきです。
理一と理二の差は小さく、2026年度は逆転した
長らく「理一の方がやや高い」状態が続いてきましたが、2026年度は公表最低点で理科二類（305.00）が理科一類（303.39）を12年ぶりに上回る逆転が起きました。共通テスト平均を差し引いた二次の推定最低点でも、理二208.8点が理一205.2点を上回っています。理一・理二の難易度差は「ほぼ同じで、年度によって入れ替わる」水準まで縮まっているのが実態です。
「最低点が下がった＝入りやすくなった」ではない
理系の合格最低点はこの3年でいずれも下がりました（理一は20点超、理三は30点超の低下）が、これは英語・数学の大幅難化で受験者全体の得点が下がったためです。合格者平均とボーダーの距離は＋17〜43点（550点満点の3〜8％）でほぼ一定。狙うべきラインが下がったわけではありません。科類別の詳しい推移と内訳は東大合格最低点【2024〜2026】で解説しています。
科類共通の合格戦略：いま合否を分けるのは理科
どの科類を選んでも、対策の優先順位は同じデータから導けます。理系合格者の二次・教科別平均（開示得点・当社集計）は次の通りです。
| 教科（満点） | 2024平均 | 2025平均 | 2026平均 | 3年間の変化 |
|---|---|---|---|---|
| 英語（120） | 80.8 | 77.5 | 65.9 | −14.9点 |
| 数学（120） | 68.8 | 57.4 | 48.7 | −20.1点 |
| 理科2科目（120） | 70.2 | 65.1 | 76.0 | +5.8点 |
英語・数学の平均が大きく沈む中、理科だけが上昇し、2026年度は二次合格最低点への寄与率で理科が首位（34.7〜37.0％）に立ちました。理一における数学の寄与率は30.7％→22.6％まで低下しています。「英数で稼いで逃げ切る」時代は終わり、理科を含む総合力で積み上げる時代に変わった――これが3科類すべてに共通する現実です。
もうひとつの共通条件が共通テストです。当社集計では、理系合格者に共通テスト得点率82％未満は3年間で1人もいません。理系にとって共テ約9割は目標ではなく前提条件です（詳しくは東大共通テスト足切りの仕組みと予想ライン）。
そして理科で稼ぐには、物理・化学の全範囲修了を待たない早期着手が鍵になります。学年別の進め方は「理科はいつから？」東大理科の早期着手ロードマップにまとめました。
科類選びの考え方：迷って対策を止めないこと
- 工学・情報・物理・数学系に進みたい → 理一
- 生物・化学・農学・薬学など生命科学系に進みたい → 理二
- 医師になりたい → 理三（理二からの医学部医学科枠も若干名あるとされますが、狭き門です）
進路が固まっていない段階なら、進学選択の幅を見ながら理一・理二で検討するのが一般的です。ただし人気の学部・学科は進学選択時に成績（進学のための平均点）で競争になるため、「入ってから考える」にも入学後の学習は必要です。
受験対策の観点で強調したいのは、科類選びで迷っている期間も、やるべき勉強は1ミリも変わらないということです。試験問題は共通、合格ラインの構造も共通。科類の最終決定は出願時期までにすればよく、高1・高2のうちは英数の土台と理科の先取りを進めることが、どの科類を選んでも効きます。独学か塾かで迷っている場合は東大対策の塾選びガイドも参考にしてください。
よくある質問（FAQ）
東大の理科一類、二類、三類の違いは何ですか？
主な進学先の違いです。理一は工学部・理学部（数物・情報系）、理二は農学部・薬学部・理学部（生命科学系）、理三は医学部医学科が中心です。入試の試験問題と配点は3科類とも共通で、合格最低点だけが異なります。
東大の理科一類、二類、三類はどっちが難しいですか？
理三が別格の最難関です（2026年度の公表最低点346.09点・合格者平均386.7点／当社集計）。理一と理二はほぼ同水準で、2026年度は公表最低点で理二（305.00）が理一（303.39）を12年ぶりに上回りました。年度によって入れ替わる程度の差と考えるのが実態に近いです。
東大合格に必要な勉強時間はどのくらいですか？
一律の正解はありませんが、直近のデータでは理科の演習期間をどれだけ確保できたかが得点差に直結しています。学年別の時間の使い方は東大合格者の勉強時間・学年別ロードマップで詳しく解説しています。
東大に行くならどこの塾がいいですか？
科類を問わず、「英数の難化に耐える土台づくり」と「理科の早期着手」に対応できるかが選定基準になります。大手・専門塾それぞれの特徴と選び方は東大対策の塾選びガイドにまとめています。カリキュラムの進度についていけるかどうかも重要な観点です（鉄緑会についていけないと感じたら）。
データの出典と注記
開示得点データは、ウェブサイト上で公開されている2024〜2026年度の東大合格者530名の本人申告開示得点を、イエナアカデミーが独自に収集・集計したものです（開示未記載30名を除くn=500）。合格最低点は東京大学公表値。
科類選びと東大対策の相談はイエナアカデミーへ
イエナアカデミーは、開示得点データの分析に基づき「どの科目で何点積み上げるか」から逆算して設計する、オンライン対応の個別指導塾です。科類選びの段階からの学習計画づくりもお手伝いします。
